Originalmente se conocía a este lugar como Valle del Carrizal. Su nombre actual le fue impuesto por una ciénega que estaba localizada en terrenos del Sargento Mayor Pedro Flores de Abrego. Se le otorgó la categoría de villa en 1863.
El municipio cuenta con uno de los platillos típicos del Estado y representativos del mismo México: el machacado con huevo, con el que, según cuenta la historia, la tía Lencha alimentaba los ingenieros que trabajaban en la construcción de la carretera a Laredo allá por el año de 1930. Platillo que hoy se prepara en las cocinas de cualquier familia del lugar y cualquier rincón de Nuevo León.
Aquí la industria tiene un lugar privilegiado, tanto por la excelente ubicación del municipio, como por su infraestructura de servicios y comunicaciones.
El Municipio vive un ambiente económico, social y político ideal para alentar la creatividad de los emprendedores.
El Municipio NO cuenta con su página oficial, pero se puede visitar la página del Gobierno de Nuevo León: http://www.nl.gob.mx/municipios/cienega-de-flores para que lo visite y conozca acerca del Municipio que alberga el machacado con huevo, famoso en todo el Estado.